Primeiramente, vá até o painel administrativo de sua loja.

No menu lateral esquerdo, vá em "Configurações".

Agora, vá para a seção "Cores de Status".

Lembrando que é possível configurar as cores de status para o Status Resumido, o Status Detalhado e também para Status Detalhado para Pedidos do Marketplace.

Agora, escolha para qual tipo de status gostaria de alterar as cores e selecione a opção "Adicionar outro(a) Cor De Status..."

Adicionar outro(a) Cor De Status Detalhado

Em "Status", selecione a opção de status para qual as cores serão customizadas.

Aguardando Pagamento
Pagamento Confirmado
Pagamento Confirmado em outro método de pagamento
Pedido em produção
Pedido em Customização
Pedido em Separação
Preparando para envio
Em faturamento
Nota Fiscal emitida
Despachado
Disponível para retirada
Entregue
Cancelado
Cancelado - pedido vencido
Cancelado por troca ou devolução
Aberto processo de troca ou devolução
Troca e devolução em andamento
Processo de troca ou devolução atendido
(Cartão de crédito) Processando transação
(Cartão de crédito) Não autorizado pela Adquirente
(Cartão de crédito) Estornado parcialmente
(Cartão de crédito) Aguardando captura
(Cartão de crédito) Estornado valor total
(Boleto bancário) Aguardando boleto ser registrado pelo banco.
(Pagamento Instantâneo) Estornado parcialmente
(Pagamento Instantâneo) Estornado valor total

Em "Cor de fundo", escolha a nova cor para o fundo daquele status.

Em "Cor do texto", selecione a opção de cor que terá a fonte daquele status.

Você pode editar para todos os status que quiser, bastando clicar em "Adicionar outro(a) Cor De Status"

Por fim vá em "Salvar e voltar à lista".

Agora é possível conferir a customização dos seus status na listagem de pedidos.

Customização do layout de Status